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python - 如何读取 hdf5 文件。并将它们绘制为图像

问题描述

我有这个 hdf5 格式的月球陨石坑数据集 https://zenodo.org/record/1133969/files/train_craters.hdf5?download=1 但我不知道如何阅读它们并查看该数据集中的图像

标签： pythondatasethdf5

解决方案

HDF5 是组织成组和数据集（又名数据模式）的任意数据的容器。为了有效地处理数据，您需要在开始编码之前了解架构。理想情况下，数据源提供模式。如果没有，您的第一步是推断模式。您可以通过打开文件并使用 HDFView（来自 HDF 组）查看，或者编写小代码片段，如链接答案中所示。

我看了你的文件。你说你想“看图像”。你不能用这些数据做到这一点。我在这里阅读了文件描述：DeepMoon 补充材料。有 6 个感兴趣的文件：

  • name _craters.hdf5 - Pandas HDFStore 数据集中图像的火山口位置和大小。
  • name _images.hdf5 - 输入 DEM 图像和数据集的输出目标，其中：
    • name = dev用于验证数据集
    • 名称=测试数据集的测试
    • name = train训练数据集

所以，如果你想要训练图像数据，你需要下载train_images.hdf5文件。警告：它是 9.9 GB。

文件评论train_craters.hdf5：
此文件由 Pandas 创建。该文件有 30_000 个组，每个图像 1 个组（命名为“img_xxxxx”）。每个组有 4 个数据集，分别命名为：“axis_0”、“axis_1”、“block0_items”和“block0_values”。他们有关于每张图像的数据，但没有任何图像数据。例如，“axis_0”和“block0_items”都有以下条目：

Diameter (km)
Lat
Long
x
y
Diameter (pix)

“block0_values”中有数据。这是“img_00000/block0_values”中的一个示例：

[[ 5.32341731 -35.10135397 -101.80962272 161.77188631 252.6564721 10.87213217]  
 [ 5.38713978 -34.86402264 -102.38375512 132.62561605 237.8560143 11.00227398]]

从这里你得到：

Diameter (km)[0] = 5.32341731
Lat[0] = -35.10135397
Long[0] = -101.80962272
x[0] = 161.77188631
y[0] = 252.6564721
Diameter (pix)[0] = 10.87213217

Diameter (km)[1] = 5.38713978
Lat[1] = -34.86402264
Long[1] = -102.38375512
x[1] = 132.62561605
y[1] = 237.8560143
Diameter (pix)[1] = 11.00227398

因此，这提供了有关每个图像的一些基本信息......但不是您可以转换为图像的像素值数组。

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