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python - 如何使用 Python 从 RDFLib 读取 URI？

问题描述

我有数千个URIRef本体值，我试图获得以下字符串表示：

[rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219'),
 rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002551'),
rdflib.term.URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/core#indirectly_supplies')]

我可以单独访问每个人的链接（例如http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219）并获取它（例如surrounded by），但是我如何使用 Python 来做到这一点？我有两种方法可以看到如何做到这一点，但我也无法弄清楚。一种方法是简单地使用RDFLib库，但我没有找到翻译链接的函数。另一种方法是解析HTML链接以获取红色值（我认为这对应于翻译）。

请注意，其中一些没有附加任何东西（例如http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/core#indirectly_suppliesis 404: Not Found）

标签： pythonurihtml-parsingrdfontology

解决方案

由于这些 URI 支持 RDF 内容协商，您只需获取 rdf 并将其加载到图表中，如下所示。获得图表后，您可以使用 SPARQL 从图表中查询您想要的属性。在下面的示例中，我获取了每个主题的标签。我还删除了您提供的 URI 之一，因为它是 404 的。

from rdflib import Graph, URIRef

uris = [URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002219'), URIRef('http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002551')]

for uri in uris:
   query = """
   SELECT ?label WHERE {
      <"""+str(uri)+"""> rdfs:label ?label.
   }
   """
   g = Graph()
   g.parse(uri)
   res = g.query(query)
   for result in res:
      print(result)

这给出了一个输出，

(rdflib.term.Literal('surrounded by', lang='en'),)
(rdflib.term.Literal('has skeleton'),)

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