r - 在 R 软件 (Windows 10) 上安装 kb-python 时出现问题
问题描述
我正在尝试安装以从原始数据(fastq 扩展)进行 RNA-seq 分析,并且我正在尝试通过运行下一行来安装 kb-python:
conda create -y --name kb python=3.8 #create an environment, specifying python v3.8
conda activate kb #activate that newly created environment
pip install kb-python #install kb-python in the environment. Note: if this fails because of an issue with pysam, then do 'conda install pysam' then retry this line.
当我运行最后一行时,它需要很多小时(超过一天。我用两台 PC 进行了尝试,一台 4GB,另一台 8GB RAM 和 300GB 存储空间)。
由于 PC 过热需要很长时间,我必须将其关闭以避免物理损坏。有什么建议吗?执行 RNA-seq 分析的任何替代方法。
我正在关注下一个教程:https ://protocols.hostmicrobe.org/conda
非常感谢!
解决方案
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