workflow - 如何从正在运行的 Snakemake 工作流程中可靠地获取状态信息？
问题描述
Snakemake 很棒，但我很难获得可靠运行工作流程的状态信息。例如， --summary 参数抱怨目录由于正在运行的进程而被锁定，这是真的，但无论如何都会吐出信息，这很好。但也许我只是走运了，在未来的版本中它会拒绝给我信息，就像 --detailed-summary 错误一样？
我正在尝试做的是将 Snakemake 集成到我的应用程序中，工作流程有很多规则，每个规则都可能需要很长时间。许多工作流程将同时执行，因此我正在寻找一种编程方式来查询状态。我能想到的最好的方法是使用 --wms-monitor 功能，而不是使用 panoptes，编写我自己的服务器。这是最好的方法吗？
解决方案
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