r - 错误：SET_STRING_ELT() 的值必须是 'CHARSXP' 而不是 dplyr group

问题描述

如下使用group_by时出现超级随机错误dplyr

dat %>% group_by(variable) %>% mutate(score = score[1])

其中dat是一个data.frame带有因子/字符的列variable并且score是一个双精度。我得到的错误是这样的：

Value of SET_STRING_ELT() must be a 'CHARSXP' not a 'character'

无论名称如何，它都会发生variable。
无论计算如何（例如score[1]）。
我可以按任何其他变量分组。
这两个变量似乎都很好。variable我可以勉强用or进行各种计算score。变量只有重复的条目“arima”和“prophet”，没有NAs。
此外，错误消息仅有时会显示。大多数情况下，R 会话只是由于致命错误而终止。

这让我疯狂...

我用谷歌搜索了这个错误并找不到很好的帮助，除了缩小范围，这就是我所做的，即一个简单的group_by计算。此外，我重新启动了 R 会话，重新启动计算机，更新了我的 R 版本和dplyr包，现在是 1.07 版。我在 Ubuntu 20.04.3 LTS 上使用 R 版本 4.1.1。

关于可能产生此错误的任何想法？

编辑我无法提供带有模拟数据的可重现样本，因为它只发生在特定数据中。在这里，我上传了导致错误的数据https://filebin.net/9pywc544hsmgm2p3

然后运行以下代码

A <- readRDS("dat.rds") %>% 
    group_by(variable) %>% 
    mutate(score = score[1])

有趣的是，如果你分组A[1:nrow(A), ]而不是A它，虽然它是相同的数据。

编辑 2： 我现在可以运行几次计算，但在某些时候，我总是会遇到相同计算的致命错误。我觉得这似乎是我的系统特有的。所以可能我必须重新安装所有东西。

编辑3： 做as.numeric(score)解决了这个问题。因此，分数的名称属性似乎有些问题。但是，它们看起来并不可疑，并且都具有相同的名称，即“new_confirmed10”。

标签： rdplyr

解决方案

这是实现 R 函数的 C 代码中的内部错误。它不应该出现在用户代码中。这绝对是某个地方的错误。traceback()您可能可以通过在看到它后立即运行来稍微缩小位置。这将列出在错误发生时所有处于活动状态的 R 函数，并可能给出调用错误 C 代码的 R 函数的位置。

请把一个可重现的例子放在一起（即给我们一种构建方法，dat以便我们可以在我们的系统上重现它）。SO 上的某个人将能够找到错误的原因，也许能够告诉你一个解决方法，或者告诉代码的作者如何修复它。

如果您不能这样做，那么任何人都不太可能帮助您，但这里有一些一般性建议：

不要使用仅在 Github 上的包或包版本，坚持使用通常经过更好测试的 CRAN 包。
如果您正在开发自己的 C/C++ 代码并且它以某种方式在这里涉及，您需要使用gdb或lldb进行 C 级调试。如果您以前没有使用过这些，那并不容易。

编辑添加：

在检查了dat.rds文件的上传版本后，我想我已经发现了部分问题。运行此代码：

dat <- readRDS("dat.rds")
table(names(dat$score))

我可以看到的名称dat$score是 744 个副本"new_confirmed10"。重复的名字是不寻常的，但合法的。但是，的长度dat$score是 1488 （与的行数相同dat），据我所知，名称的数量与对象的长度不同是不合法的。（如果您只为某些元素分配名称，则应该NA在其他元素上获得名称。）

当您运行代码时，mutate 调用中的某些内容会崩溃，因为它假定对象格式正确，但事实并非如此。所以这不是中的错误dplyr，但我认为这是创建对象的任何代码中的错误dat.rds。你有任何关于它是如何创建的记录吗？

r - 错误：SET_STRING_ELT() 的值必须是 'CHARSXP' 而不是 dplyr group_by 中的“字符”

问题描述

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