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r - 联合多行数据框

问题描述

有没有办法将数据框的多行与多列结合起来？

我有来自不同动物器官的数据——我想对比个人的器官。一行应仅包含个体的测量值，但应包含所有采样器官（列）。任何的想法？我试过融化命令没有管理它。

这是我的一些数据：

structure(list(ID = c("BB1", "BB1", "BB1"), ID.organ = c("BB1-B", 
"BB1-L", "BB1-M"), d15NAIR = c(6.244803447, 5.263374719, 6.28820367
), brain = c(-31.00047084, NA, NA), eyes = c(NA_real_, NA_real_, 
NA_real_), liver = c(NA, -30.8483728, NA), muscle = c(NA, NA, 
-29.67755736)), row.names = c(NA, 3L), class = "data.frame")

标签： rrowsmelt

解决方案

你在使用melt的正确方式，你只需要确定你使用的是哪个melt函数data.table::melt或reshape2::melt，有很多方法可以做到这一点看看答案在这里。

这是您的数据：

mydata <- structure(list(ID = c("BB1", "BB1", "BB1"), 
                          ID.organ = c("BB1-B",  "BB1-L", "BB1-M"), 
                          d15NAIR = c(6.244803447, 5.263374719, 6.28820367),
                          brain = c(-31.00047084, NA, NA), 
                          eyes = c(NA_real_, NA_real_, NA_real_),
                          liver = c(NA, -30.8483728, NA), 
                          muscle = c(NA, NA, -29.67755736)), 
                     row.names = c(NA, 3L), 
                     class = "data.frame")

library(reshape2)
melt(mydata, id.vars=c("ID", "ID.organ",  "d15NAIR"), na.rm = TRUE)

library(tidyr)
gather(mydata, organ, value, c("brain", "liver", "muscle"), na.rm = TRUE)

#     ID ID.organ  d15NAIR variable     value
# 1  BB1    BB1-B 6.244803    brain -31.00047
# 8  BB1    BB1-L 5.263375    liver -30.84837
# 12 BB1    BB1-M 6.288204   muscle -29.67756

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