首页 > 解决方案 > 熊猫将数据框转换为床文件?

问题描述

我使用 pandas.to_csv() 通过执行以下操作将 pandas 数据帧转换为 BED 文件:

pd.to_csv('xxx.bed', index=False, sep='\t', header=None)

我想知道这是否可以成功地将数据框转换为床文件,或者我只是将数据框导出为 csv 文件。

标签: pandasexport-to-csvbed

解决方案


床文件遵循固定宽度格式,因此to_csv不会直接有用。

你有两个选择:

1-将您的列转换为具有固定宽度的填充的字符串,然后导出到 csv

2-用于tablulate导出为固定宽度(有关详细信息,请参阅此答案)


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