首页 > 解决方案 > snakemake:将 conda envs 归档为 yaml

问题描述

在每个蛇形管道运行后,我想保存每个 conda env 的 yaml 导出(通过onsuccess:)。可以创建整个管道的 tarball,但我只想将 conda envs 导出为 yaml 文件,特别是考虑到创建所有内容的 tarball 需要多长时间。我还没有找到这样做的好方法,尤其是在将工作流中的 conda env 名称与.snakemake/conda/.

标签: condasnakemake

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