首页 > 解决方案 > 从 uniprot 加入 r 中检索 Fasta

问题描述

我正在尝试使用包中的getFASTAFromUniprot函数从Rcpi加入列表中检索 Fasta 信息。

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("Rcpi")

library(Rcpi)
ids <- c("Q9H2L4", "Q9NUN7", "P05413")
fastas <- getFASTAFromUniProt(ids)

我得到这个结果

fastas chr [1:3] """"""

这是我正在使用的代码,我也尝试了该UniprotR软件包,但效果不佳。

我知道这个问题已经在其他线程中被问过,但我想知道是否有人对此有解决方案。

如何从 UniProt 获取 .FASTA 文件,知道蛋白质代码,使用 R?

干杯

标签: rfasta

解决方案


推荐阅读