python - 无法使用 PyCall 从 Python 调用 julia 代码，其代码使用 Pycall 回调 python

Question

我有一个进行 julia 调用的后端算法，我通过 PyCall 包执行此操作。但是，最近更新了 julia 中的一个包，它本身使用了 PyCall。无论我尝试做什么，我总是会出错。如果我通过 Pkg.build("PyCall") 在 julia 中设置 pycall，我可以调用包，但是 python 不能调用 julia。如果我通过 julia.install() 在 python3 中设置 pycall，则该包无法在 julia 中正常运行。

在这里重现这个是一个简单的例子：

测试.jl

using Pkg
Pkg.add("PyCall")
ENV["PYTHON"]=""
Pkg.add(PackageSpec(url="https://bitbucket.org/SSamanipour/safd.jl/src/master/"))
Pkg.build("SAFD")
Pkg.test("SAFD")

测试.py

from julia import Main as jl
jl.include("test.jl")

如果我跑python3 test.py

我遇到一个错误，因为该特定 python 未配置 py 共享 pycall。

我想要的是python中的pycall与python不同。似乎如果您将 pycall 配置为一个，它将强制另一个。

我尝试使用 juliacall，但是如果我将 pycall 与它一起使用，它似乎也会中断。

如果我尝试拥有ENV["PYTHON"]="python3"，我将无法运行 SAFD 包。

任何帮助将不胜感激，因为我已经在这方面待了几天并尝试了多种解决方案，但一切似乎都给了我一个不同的错误。

一些信息：在 aws amazon2 linux 操作系统和 aws r5.large 实例上执行此操作。

我正在使用 python 3.10.0

versioninfo() Julia 版本 1.6.3 提交 ae8452a9e0 (2021-09-23 17:34 UTC) 平台信息：操作系统：Linux (x86_64-pc-linux-gnu) CPU：Intel(R) Xeon(R) Platinum 8175M CPU @ 2.50GHz WORD_SIZE：64 LIBM：libopenlibm LLVM：libLLVM-11.0.1（ORCJIT，skylake-avx512）

编辑：

我最终解决了这个问题，我尝试使用的包更新了它的依赖项，当它构建时，它会自动使用它需要的所有包更新 conda python。但是，如果它不是由 conda 构建的，它将假定存在依赖项。令我感到非常惊讶的是，错误消息从未表明任何有关特定包的信息。我只是偶然发现了一点。

有一点很清楚，你不能有两个不同的python，pycall只配置一个python用于python和julia之间的来回。

标签： pythonpython-3.xjuliapycall

Answer 1

您的系统上似乎有 2 个 Python：

• 之后安装的第一个ENV["PYTHON"]="";Pkg.build("PyCall")--> 这是在 Julia 中安装 PyCall 以使一切正常的默认方式（这实际上是一个 Miniconda Python）
• 您开始使用的系统 Pythonpython3

基本上，混合这 2 条 Python 并让一切正常工作就像大海捞针被蒙住眼睛。而不是你需要使用一个 Python 来处理所有事情并让事情顺利运行，这应该是 Julia 在执行 ENV["PYTHON"]="";Pkg.build("PyCall").

为了在 Julia 控制台中找到要使用的 Python：

julia> using PyCall

julia> PyCall.python
"/home/ubuntu/.julia/conda3/python.exe"

现在您找到了所需的 Python 代码！所以你在 bash 中运行的是：

/home/ubuntu/.julia/conda3/python.exe test.py