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r - 从 conda 安装 gdal 2.3 后，sf R 包“与 2.0.0 以下的 GDAL 版本不兼容”

问题描述

在尝试安装sfR 包时，我收到了错误消息：

checking GDAL version >= 2.0.0... no
configure: error: sf is not compatible with GDAL versions below 2.0.0

然后我从 conda安装了gdal2.3.1并确认了版本：

gdalinfo --version

GDAL 2.3.1，发布于 2018 年 6 月 22 日

但我仍然收到相同的错误消息。

R 3.5 上的 SF 找不到正确版本的 gdal看起来很相似，但他们的解决方案涉及在 conda 之外安装。我在 Ubuntu 上。

如何sf识别gdal我安装的正确版本？

编辑：sessionInfo()在R节目中：

R version 3.5.1 (2018-07-02)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.4 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/libblas/libblas.so.3.6.0
LAPACK: /usr/lib/lapack/liblapack.so.3.6.0

locale:
[1] C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.5.1 tools_3.5.1

从 conda 安装 R 时我遇到了另一个问题

编辑：通过 conda 从 conda 安装 R 时conda install -c r r，出现此错误：

-----Error: libudunits2.a not found-----
     If the udunits2 library is installed in a non-standard location,
     use --configure-args='--with-udunits2-lib=/usr/local/lib' for example,
     or --configure-args='--with-udunits2-include=/usr/include/udunits2'
     replacing paths with appropriate values for your installation.
     You can alternatively use the UDUNITS2_INCLUDE and UDUNITS2_LIB
     environment variables.
     If udunits2 is not installed, please install it.
     It is required for this package.

udunits安装和udunits2从 conda安装后仍然是这种情况：

conda install -c conda-forge udunits
conda install -c conda-forge udunits2

标签： rubuntucondagdal

解决方案

以下对我有用，尽管我在 Centos 6 而不是 Ubuntu 16.04 上运行它。

conda create -n rsf r-udunits2 geos gdal proj4
source activate rsf
R

.

install.packages("sf")
library("sf")

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