r - 如何使用 R 中的一些嵌套因子来处理不平衡的 Model II 和 Model III 分析？

Question

我继承了一个用于分析的数据集，由于后勤和项目实地工作的突然结束，它相当混乱……非常不平衡！我对如何在 R 中处理它感到非常迷茫，因为我之前只做过平衡的 I 型方差分析。

对于那些感到格外耐心和慈善的人来说，这是一长串的问题！！我什至不确定 Stack Overflow 上是否允许此类问题，如果不允许，请告诉我，我会删除它。

就这样……</p>

实验设计如下所示：

因素如下：

我很不确定我在上表中的距离分类......有什么想法吗？

我实际上想对数据提出的问题是：

1. BD 的变化是使用每个浸井的单个坑捕获的，还是有必要从每个站点的多个坑中挖掘和采样？（本质上，这是一个方法问题）

只有灌木丛有多个坑，所以我只能用灌木丛来回答这个问题。

2. 土地覆盖会影响 BD 吗？

3. 在灌丛覆盖中，BD 是否随距离运河的距离而变化？

我想检查我的问题的模型结构应该是什么。我的猜测是：

问题 1 和 3：（仅使用清理数据）：

BD ~ ((transect/dipwell)*distance)/pit*depth

我几乎 100% 确定这是错误的，因为我不知道如何正确包含距离。没有距离我会有

BD~(transect/dipwell/pit)*depth.  

你如何在其中粘贴非嵌套因素？还可以吗？？

问题2（使用整个数据框）：

BD~(landcover/transect/dipwell/pit)*depth)

展望未来，为了分析上述内容，我很确定 aov 函数是不合适的，因为它只处理平衡的 I 型情况。所以我想我可以使用lm。我知道这可以用于 Model III 的情况，它可以用于 Model II（即问题 1 和 3）吗？但是我以前从未使用过此功能，有人可以指导我找到可以帮助我完成该过程的资源吗？接受其他建议。

几天来我一直在谷歌搜索解决方案，但这是一个特殊的案例，我找不到我需要的东西才能走上正轨。

非常感谢！

标签： rnestedlm