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python - 将 Eigen 库与 cppyy 一起使用

问题描述

我已经成功地将cppyy用于我正在处理的 C++ 项目的自动 python 绑定。我最近包含了Eigen库，但我无法将它与 cppyy 一起使用。有没有人有这样做的经验，或者知道我应该怎么做？

我有以下回购结构（仅显示相关部分）：

.
├── CMakeLists.txt
├── build
├── external
   ── eigen
├── include
   ── all .hpp files
├── src
   ── all .cpp files
├── python
   ── qmc.py

这external/eigen是Eigen GitHub repo的副本。该qmc.py文件是 cppyy 魔法发生的地方，它看起来像这样（在尝试添加 Eigen 之前，这工作得很好）

import cppyy
import tempfile
import os
import glob

try:
    current_dir = os.path.dirname(__file__)
except NameError:
    current_dir = os.getcwd()
source_dir = os.path.dirname(current_dir)
install_dir = os.path.join(source_dir, 'build')
include_dir = os.path.join(source_dir, 'include')
eigen_dir = os.path.join(source_dir, 'external', 'eigen')
print(current_dir, source_dir, include_dir, install_dir)

def cmake_run(build_type='Release', c_compiler='gcc', cxx_compiler='g++'):
    os.environ['CC'] = c_compiler
    os.environ['CXX'] = cxx_compiler
    os.system('cd {} && cmake {} -DCMAKE_BUILD_TYPE={}'.format(install_dir, source_dir, build_type))

def load_library():
    os.system('cd {} && make engine'.format(install_dir))
    libraries = glob.glob(os.path.join(install_dir, 'libengine.*'))
    print('Found libraries: {}'.format(libraries))
    library = libraries[0]
    cppyy.load_library(library)
    for header in glob.glob(os.path.join(include_dir, '*.hpp')):
        print('Loading {}'.format(header))
        cppyy.include(header)

构建部分可以工作，但是一旦我尝试加载任何使用 Eigen 的标头，就会出现错误。我已经尝试了几乎所有我能想到的东西（一个一个地手动包含所需的头文件，将整个库复制到构建目录等），但无论我做什么，都会弹出相同类型的错误。就像是

In file included from 
/path/to/repo/projects/include/myheader.hpp:3:10: fatal error: 'Eigen/Dense' file not found
#include <Eigen/Dense>
         ^~~~~~~~~~~~~

任何有关此处更改内容的帮助将不胜感激！

编辑：需要明确的是，构建步骤工作得很好，即代码编译、链接和运行。使用 cppyy 加载库也可以。问题是 cppyy 还需要包含头文件。同样，这适用于我自己的标题，但无法找到 Eigen 标题...

标签： pythonc++eigenpython-c-api

解决方案

调用 help() 时，有：

>>> import cppyy
>>> help(cppyy)
    """
    add_include_path(path)
        Add a path to the include paths available to Cling.
    """
>>>

因此，eigen_dir作为通往 Eigen 的道路，这应该是门票：

cppyy.add_include_path(eigen_dir)

不过，有更好的方法，因为您已经在使用 cmake。请参阅此仓库： https ://github.com/jclay/cppyy-knearestneighbors-example 。这样，自动加载应该可以工作。即无需在您自己的代码中处理库和头文件。

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