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sed - 如何使用“sed”在 tsv 文件中查找和替换值？

问题描述

我目前正在处理一个包含两列的大型 .tsv.gz 文件，如下所示：

xxxyyy  408261
yzlsdf  408260null408261
zlkajd  408258null408259null408260
asfzns  408260

我想做的是找到所有包含“null”的行并将其替换为逗号“，”。所以结果看起来像这样：

xxxyyy  408261
yzlsdf  408260,408261
zlkajd  408258,408259,408260
asfzns  408260

我曾尝试使用以下命令，但没有奏效：

sed -i 's/null/,/g' 46536657_1748327588_combined_copy.tsv.gz

解压缩文件并再次尝试也不适用于 tsv 文件。

我还尝试在文本编辑器中打开解压缩文件以手动查找和替换。但是文件太大，会崩溃。

标签： sedcommand-line

解决方案

尝试：

zcat comb.tsv.gz | sed 's/null/,/g' | gzip >new_comb.tsv.gz && mv new_comb.tsv.gz comb.tsv.gz

因为这避免了一次解压缩文件，所以应该节省内存。

例子

让我们从这个示例文件开始：

$ zcat comb.tsv.gz 
xxxyyy  408261
yzlsdf  408260null408261
zlkajd  408258null408259null408260
asfzns  408260

接下来，我们运行我们的命令：

$ zcat comb.tsv.gz | sed 's/null/,/g' | gzip >new_comb.tsv.gz && mv new_comb.tsv.gz comb.tsv.gz

通过查看输出文件，我们可以看到进行了替换：

$ zcat comb.tsv.gz 
xxxyyy  408261
yzlsdf  408260,408261
zlkajd  408258,408259,408260
asfzns  408260

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