r - 如何从我的 NMDS 图中检索原始输出数据？

Question

我已经使用 vegan 包进行了 NMDS 分析，并生成了下图。我现在想提取图中每个点的值（来自 NMDS 1 轴的 x 值和来自 NMDS 2 轴的 y 值）。我在网上做了一些搜索，但没有找到任何解决方案。有没有人这样做过？

数据组织为一个数据框，有 4 列，图中每个北极栖息地各一列，共有 208 行，每行是每个北极栖息地中物种的总数。

这是我用来生成图表的代码：

library(vegan)

arctichabitat<-read.csv(file.choose())

arctichabitat.nmds <- metaMDS(arctichabitat, distance = "bray", trace = F, trymax = 100)

plot(arctichabitat.nmds)
text(arctichabitat.nmds, display = "species", csv = 0.5)

我该如何解决这个问题？

标签： rvegan

Answer 1

所有纯素排序对象都具有scores可以提取您要求的值的功能。这甚至被记录在案：参见?metaMDS.