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r - 我在数据框的下标分配中不允许缺失值有错误

问题描述

我是 R 新手，我正在为我的个人项目/练习构建 R 代码。我使用的数据是关于香港人种族认同的调查。我使用了来自http://data.hkupop.hku.hk/v3/hkupop/ethnic_identity/ch.html的2019 年数据。

在删除 NA 值并将列减少到我需要的列之后，我注意到数据高度不平衡，因此我尝试使用欠采样、ROSE 和 SMOTE。（数量从 1015 次大幅减少到 573 次）

我从集合中删除了以下列#

df_f <- df[,-c(1,2,5,6,8,9,11,12,14,15,17,18,20,21,25,26,27,29,32,33,34,35,37)]

但是，这不是二进制数据，因此我不得不强制 eth_id 中的因素组合成 0 = 1&3（香港人和香港中国人）和 1 = 2&4（中国人和中国香港公民）

我如何结合这些因素

df_p$eth_id <- recode(df_p$eth_id, "c('1', '3')='1+3';c('2', '4') = '2+4'")

library(plyr)

revalue(df_p$eth_id, c('1+3' = 0)) -> df_p$eth_id
revalue(df_p$eth_id, c('2+4' = 1)) -> df_p$eth_id

我如何重命名列

df_f <- df_f %>%  
              rename(
                        eth_id = Q001,
                        HongKonger = Q002A, 
                        Chinese = Q003A, 
                        PRC = Q004A,
                        CH_race = Q005A, 
                        Asian = Q006A, 
                        global = Q007A,
                        class1 = mid, 
                        housing1 = type, 
                        housing2 =  housingv2, 
                        pi = inclin 
                      )

我如何处理我的 NA 和不必要的异常值

对于 [,2:7] 列，我将它们的值更改为 0 用于 NA，例如，df_f$HongKonger <- ifelse(is.na(df_f$HongKonger),0,df_f$HongKonger)依此类推。

对于其他人，我删除了这样的 NA：

df_p <- na.omit(df_p, cols= c("eth_id","sex","agegp","edugp","occgp","class","class2","housing1","housing2","pi"), invert=FALSE)

在我的数据集的这一点上，我剩下 14 列，我将它们重命名（请参阅上文）。我上传了我用于 ROSE 和 SMOTE 的数据的最终结构 :-)

此外，我还删除了异常值的行，例如：

删除无法识别的种族身份（8881 或级别 = 5）

df_f <- df_f[!df_f$Q001 == "8881",] table(df_f$Q001) 
df_f <- df_f[!df_f$eth_id == "Don't know / hard to say",]

现在，当我运行 ROSE 时，我不断收到此错误：Error in [<-.data.frame( *tmp*, , indY, value = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, : 在数据帧的下标分配中不允许缺失值。

这是非常具有误导性的，因为我确保完全删除 NA 值（因为与此相关的所有问题都与 NA 问题有关，这不适用于我的问题），我什至将所有因子值都更改为数值。（因为我认为程序不理解？因子值。）

我还收到 SMOTE 的此错误消息：名称错误（dn）<- dnn：尝试将属性设置为 NULL。这个马克

es me even more confused to the level that I am doubting the data itself being not applicable to machine learning. 

Here is the final structure of my data for your reference: 
'data.frame':   573 obs. of  14 variables:
 $ eth_id    : Factor w/ 2 levels "0","1": 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 ...
 $ HongKonger: num  9 0 0 0 0 2 0 2 0 8 ...
 $ Chinese   : num  9 9 1 3 7 0 7 9 0 0 ...
 $ PRC       : num  8 9 1 3 7 3 1 0 1 0 ...
 $ CH_race   : num  12 10 0 3 7 3 0 7 3 4 ...
 $ Asian     : num  0 7 6 0 0 2 2 0 0 6 ...
 $ global    : num  0 0 0 0 0 3 7 0 10 0 ...
 $ sex       : num  1 2 2 1 2 1 1 2 1 2 ...
 $ agegp     : num  6 5 2 2 6 5 2 4 6 1 ...
 $ edugp     : num  2 3 2 3 1 2 2 2 3 3 ...
 $ class1    : num  3 3 3 5 3 3 4 4 4 3 ...
 $ housing1  : num  1 1 2 2 1 2 1 2 1 1 ...
 $ housing2  : num  3 3 1 4 3 1 2 1 3 3 ...
 $ pi        : num  3 2 1 2 1 1 1 4 1 1 ...
 - attr(*, "na.action")= 'omit' Named int  14 24 46 52 58 67 77 84 94 129 ...
  ..- attr(*, "names")= chr  "25" "44" "82" "90" ...

#How I divided the data into train and test set 

    set.seed(123)
    index <- createDataPartition(df_p$eth_id, p = 0.7, list = FALSE)
    train_data <- df_p[index, ]
        test_data  <- df_p[-index, ]

    head(test_data)
    str(train_data)

    #How I used ROSE for under-sampling  

library(ROSE)
ovun.sample(formula = train_data$eth_id ~ ., data = train_data, method="under", N = 250,seed = 123)$data

我如何将 ROSE 用于“两者”

ovun.sample(formula = train_data$eth_id ~ . , data = train_data, method="both",
            na.action=options("na.omit")$na.action,p=0.5,seed = 123)$data

我如何使用 SMOTE

SMOTE(form = train_data$eth_id ~., data = train_data, perc.over = 100, k = 5, perc.under = 200)

我不断得到： 1）对于 ROSE：（[<-.data.frame, *tmp*, indY, value = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 中的错误）：在数据帧的下标分配中不允许缺少值

2) 对于 SMOTE: Error in names(dn) <- dnn : 尝试将属性设置为 NULL

谢谢你，谢谢你提前分享你的知识。

标签： rimbalanced-datasmote

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