r - 在 R 中使用两个数据帧进行 PCR

Question

我是一名生物学家，我在几个地方对生物多样性进行了研究。此外，我测量了这些地块中的环境变量。通常，我会在 Canoco5 中分析这些数据，但是，我也在尝试学习 R。我的数据框如下所示：

          Arthopleidae Baetinae Cloeninae Caenidae etc.
Location_1           0        3        16        0
Location_2           0        0         0        5
Location_3           0        1        40        0
Etc.

和：

                    pH  Temperature Vegetation etc.
Location_1         8.22       28.06          0
Location_2         8.15       28.95         30
Location_3         8.29       28.75          0
Etc.

我找不到适合这种分析的软件包。你会推荐什么？

提前致谢！

标签： r

Answer 1

查看vegan 包（可在 CRAN 或 GitHub 中获得）。它具有 Canoco5 中可用的所有排序方法，并将 will 与其他 R 包（例如，zoo、tidy）集成。我会考虑vegan用现代的“插入式”替代 Canoco，并且还有一些可用的非参数方法（例如，非度量 MDS）。

这是包装说明。

vegan 软件包为描述性社区生态提供了工具。它具有多样性分析、社区排序和相异性分析的最基本功能。它的大多数多变量工具也可用于其他数据类型。