r - 分类变量的频率表作为 R 中的数据框
问题描述
我想在 R 中创建所有分类变量的频率表作为数据框。我想找到每个调查响应的频率和百分比（按条件分组，以及总频率）。我想将其生成为数据框。
仅一个变量（“q1”）的所需频率计数示例。我希望数据中的大多数变量具有类似的频率计数：
我有这样的数据。实际数据有更多的分类变量。
library(readr)
data_in <- read_table2("treatment_cur q13_3 q14_1 q14_2 q14_3 q14_4 q14_5 q14_6 q14_7 q14_8 q14_9 q14_10 q14_11 q14_12 q14_13 q14_14 q14_15
Control 3 2 3 6 5 6 6 6 4 5 5 5 4 6 6 5
Control 2 4 5 6 5 6 5 5 6 4 5 5 6 5 4 6
Treatment 3 1 2 6 4 6 5 4 6 4 6 1 5 6 4 6
Control 3 2 3 6 4 6 6 6 6 6 6 6 6 5 5 6
Control NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
Control 4 6 5 6 5 6 5 6 6 5 1 1 6 5 5 6
Control 3 3 2 2 3 3 6 6 4 6 5 5 3 6 6 2
Treatment 2 3 2 3 1 3 1 1 1 3 3 3 3 3 3 1
Control 3 5 5 6 3 6 3 3 3 2 2 1 4 2 3 4
Control 2 1 1 1 1 1 4 4 1 1 1 1 1 4 4 2
Control 4 3 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Control 4 2 6 6 4 6 5 6 6 5 6 5 6 6 6 6
Control 2 2 3 3 2 3 5 6 5 3 3 3 3 5 3 2
Control 3 2 4 3 4 5 4 4 5 3 3 5 4 5 5 4
Treatment 2 2 2 2 2 3 1 1 2 2 3 2 3 3 2 3
Control 4 3 3 3 5 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Treatment 2 1 3 3 2 1 3 4 2 2 3 3 2 3 3 3
Treatment 4 2 6 4 4 2 3 5 4 5 1 1 5 4 4 5
Control 3 3 3 4 4 4 4 5 3 2 5 4 5 5 4 4
Control 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 5 6 6 5
Control 2 2 3 6 2 5 1 2 4 4 1 1 6 4 4 6
Treatment 4 3 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Treatment 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Treatment 1 1 2 4 4 4 1 1 1 1 1 1 6 1 1 6
Treatment 3 2 3 3 2 6 6 6 6 3 3 2 4 5 5 6
Control 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1
Control 1 3 3 3 1 1 5 5 2 4 5 5 4 1 2 5
Treatment 3 4 4 5 5 4 4 4 3 5 3 4 4 6 6 5
Control NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
Control 2 2 4 6 2 4 2 2 3 5 4 4 4 3 3 5
Treatment 1 1 2 1 1 1 1 1 6 1 1 1 6 2 3 6
Treatment 2 6 1 4 4 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2
Treatment 3 3 4 4 4 6 6 5 4 6 3 5 5 6 6 4
Treatment 2 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3
Control 4 3 4 6 4 6 4 5 6 3 4 4 6 6 4 6
Control 4 4 3 6 2 5 2 2 4 3 1 6 5 5 5 5
Control NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
Treatment 2 3 3 6 5 6 1 2 6 5 4 4 5 5 5 6
Control 4 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 6 5 5 5 5
Treatment 2 1 1 3 1 3 4 4 4 4 1 4 3 4 4 4
Treatment 2 1 3 3 3 3 4 6 5 4 5 5 4 6 6 5
Control 4 6 6 6 6 6 5 5 5 6 6 5 5 5 6 6
Control NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
Control 4 2 2 4 2 4 6 6 6 6 4 6 5 6 6 5
Control 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
Treatment 3 4 2 5 5 5 6 5 5 5 5 5 5 6 6 6
Control NA 2 4 4 4 4 4 3 4 6 4 5 4 6 4 4
Control 2 2 2 3 1 3 4 1 1 1 2 1 3 3 3 3
Treatment 2 2 2 3 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2
Control 3 3 3 6 6 6 6 6 6 6 5 6 6 6 6 6
Treatment 2 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 3
Treatment 4 5 5 6 6 5 5 6 5 5 4 5 5 4 4 5
Control 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
Treatment 3 3 4 4 4 6 3 2 5 3 2 2 5 6 5 6
Control 4 4 3 3 6 3 6 6 3 2 4 4 4 4 4 4
Treatment 4 1 3 4 4 4 5 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Control 4 4 5 6 5 5 4 6 6 6 6 5 6 6 6 6
Treatment 3 3 4 6 6 6 6 6 5 6 6 5 4 6 6 4
Control 4 4 6 6 4 6 6 6 6 4 4 3 5 6 6 6
Control 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Treatment 4 5 5 6 6 6 6 6 5 5 6 6 5 5 6 6
Treatment 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Control 2 1 2 1 1 1 1 3 1 4 4 1 1 1 1 1
Treatment 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
Treatment 4 6 5 5 5 5 5 6 5 4 5 4 4 5 5 4
Treatment 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
Control 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4
Treatment 4 5 6 6 6 5 6 6 6 5 6 6 6 6 6 6
Control 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
Treatment 3 3 2 5 4 4 5 6 6 4 5 5 4 5 4 6
Treatment 4 5 4 4 4 5 5 6 4 5 4 3 6 6 6 6
Control 1 2 3 2 1 4 1 1 3 1 3 3 3 3 4 4
Control 3 6 6 6 6 6 5 1 5 6 5 6 6 6 6 6
Control 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
Control 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
")
我目前的解决方案太复杂了。如果我想知道 q13_3:q14_9 中变量的频率，我知道我可以这样做来找到它：
library(tables)
varList <- 2:11
data_in[varList] <- lapply(data_in[varList], factor,exclude = NULL)
lapply(varList,function(x,df,byVar){
tabular((Factor(df[[x]],paste(colnames(df)[x])) + 1) ~ ((Factor(df[[byVar]],paste(byVar)))*((n=1) + Percent("col"))),
data= df)
},data_in,"treatment_cur")
下面是我当前输出的一个片段。问题是输出是无法导出到单个 Excel 工作表中的列表列表。我必须手动将控制台中的所有内容复制到 Excel 文件中。
treatment_cur
Control Treatment
q14_8 n Percent n Percent
1 6 13.953 4 12.50
2 4 9.302 4 12.50
3 5 11.628 2 6.25
4 6 13.953 4 12.50
5 5 11.628 7 21.88
6 13 30.233 11 34.38
NA 4 9.302 0 0.00
All 43 100.000 32 100.00
[[10]]
treatment_cur
Control Treatment
q14_9 n Percent n Percent
1 6 13.953 4 12.50
2 6 13.953 4 12.50
3 4 9.302 4 12.50
4 6 13.953 5 15.62
5 5 11.628 8 25.00
6 12 27.907 7 21.88
NA 4 9.302 0 0.00
All 43 100.000 32 10
这工作正常，但我想：
- 找到每个变量值的总频率（治疗+条件）作为附加列（如上图所示）；
- 我不喜欢我用来产生这个输出的函数。我想将它导出到一个 excel 文件中，但由于这个输出实际上是一个列表列表（它不能导出到 excel），我发现将这些值从控制台复制并粘贴到 excel 中非常麻烦。我想要一种更简单的方法来找到这些频率！当然 R 有更好的方法来做到这一点......
任何帮助深表感谢！！
解决方案
一种方法是探索使用gtsummary包。
使用上面的代码，您可以很容易地生成一个带有计数和百分比的表格：
library(gtsummary)
library(readr)
library(flextable)
tbl_summary(data_in, by = "treatment_cur") %>%
add_overall() %>%
as_flex_table() %>%
flextable::save_as_docx(., path = "G:/test.docx")
如果你只是运行：
tbl_summary(data_in, by = "treatment_cur") %>%
add_overall()
您将看到它为您生成的表格。之后的额外代码使其能够导出到 docx 文件。从那里您可以将其复制到excel中。这会生成您请求的计数，您可以确定它是否是一个更简单的实现。
另一种选择是直接写入 csv 文件：
tbl_summary(data_in, by = "treatment_cur") %>%
add_overall() %>%
as_tibble() %>%
readr::write_csv( .,path = "G:/test.csv")
或者，如果您真的需要单独列中的所有内容，您可以将 n 和百分比分成两个表，合并它们然后写入 csv。
#keep counts only
ncount <- tbl_summary(data_in, by = "treatment_cur",
statistic = all_categorical()~ "{n}") %>%
add_overall()
#keep pcts only
pctdata <- tbl_summary(data_in, by = "treatment_cur",
statistic = all_categorical()~ "{p}%") %>%
add_overall()
#combine and output
tbl_merge(list(ncount, pctdata)) %>%
as_tibble() %>%
readr::write_csv(., "G:/test2.csv")
编辑：解决这个问题的另一种方法是使用 janitor 包。您可以很容易地修饰计数和百分比并将数据集合并在一起。之后很容易导出到 csv/Excel。这里的一个缺点是您必须遍历变量以获取每个变量的表，然后将它们组合在一起，但是下面的代码是创建它的良好开始：
library(janitor)
datatry <- data_in %>%
janitor::tabyl( q13_3,treatment_cur) %>%
adorn_totals("col") %>%
adorn_totals("row")
datatry2 <- data_in %>%
janitor::tabyl( q13_3,treatment_cur) %>%
janitor::adorn_percentages(denominator = 'col') %>%
adorn_totals("row") %>%
adorn_totals("col") %>%
mutate(Total = ifelse(is.na(q13_3), Total, ifelse(q13_3 == 'Total',1, Total)))
datatry3 <- inner_join(datatry, datatry2, by = 'q13_3') %>%
mutate(variable ='q13_3')
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