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r - 使用 lapply 从多个 lmer 模型中提取系数

问题描述

我已经有一段时间了，但无法有效地做到这一点。我想跨多个变量运行许多 lmer 模型，并从每个模型中提取系数以放入数据框中。

到目前为止，我有以下

ivlist<-c("hp",  "drat", "wt", "qsec", "vs", "am", "gear", "carb")
mtcars<-mtcars
mtcars$id<- sample(c(1:16), 32, replace=TRUE, prob = c(1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16, 1/16))



mod <- lapply(ivlist, function(x) {
  lmer(substitute(mpg ~ cyl + disp + i*disp + (1|id), list(i = as.name(x))), data = mtcars, na.action=na.exclude)
})
res <- lapply(seq_along(mod[c(1:8)]), function(j) {
model = names(mod[[j]])
Vcov <- vcov(mod[[j]], useScale = FALSE)
betas <- fixef(mod[[j]])
se <- sqrt(diag(Vcov))
zval <- betas / se
pval <- 2 * pnorm(abs(zval), lower.tail = FALSE)})

do.call(cbind(names,betas, se, zval, pval), res)

我现在被困住了。它告诉我没有 se 对象。你们能帮忙吗。如果您能建议我如何仅针对交互效果执行此操作，那就更好了。

先感谢您

标签： rlapplylme4

解决方案

在R中，我们得到最后一个输出为return。在这里，我们可能需要返回 alist或作为命名向量中的所有对象

res <- lapply(seq_along(mod[c(1:8)]), function(j) {
        model <- names(mod[[j]])
         Vcov <- vcov(mod[[j]], useScale = FALSE)
         betas <- fixef(mod[[j]])
         se <- sqrt(diag(Vcov))
         zval <- betas / se
         pval <- 2 * pnorm(abs(zval), lower.tail = FALSE)
         list(betas = betas, se = se, zval = zval, pval = pval)
     })

do.call(rbind, lapply(res, as.data.frame))
#                  betas           se       zval         pval
#(Intercept)  39.5138536412 2.988611e+00 13.2214778 6.595523e-40
#cyl           0.3492185844 9.057326e-01  0.3855648 6.998190e-01
#disp         -0.0805987883 2.376294e-02 -3.3917859 6.943868e-04
#hp           -0.1074943073 3.537576e-02 -3.0386435 2.376459e-03
#disp:hp       0.0003166872 1.121111e-04  2.8247615 4.731583e-03
#(Intercept)1 10.6595603973 1.187663e+01  0.8975240 3.694394e-01
#cyl1         -0.8828858263 7.606152e-01 -1.1607522 2.457427e-01
# ...

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