indexing - 如何优化压缩时间序列数据集的倒排索引

Question

我正在尝试以 25% 的压缩率压缩时间序列数据集。这对我来说变成了仇杀。

数据是 1 个月内的 1 分钟间隔历史股票报价（参见数据集注释），缺失数据为 0。这相当于大约 9000 个 uint32_t 类型的数据点（我不做小数）

我的第一次尝试是对所有数据使用 FastPFor 压缩。这导致了约 80% 的压缩比。还不够好。所以 -

我首先摆脱所有时间戳（明显）

然后我对历史数据进行了排序并删除了所有重复项。这将唯一值的数量从 ~ 5000 减少到 1000。从那里，我使用差分SIMD 压缩算法进一步压缩它。这些也有点包装。这导致最终约 5% 的压缩比。伟大的！问题来了。

要重建数据集，您必须能够将其按顺序放回原处。我的想法是为上面每个处理过的值设置倒排索引——每个索引都指向它的原始位置。这当然只是添加了 9000 个数字。这使尺寸几乎达到原始尺寸。

例子：

Values    Indexes 

10  ===>  40, 20, 55, 100, 56, 21 

25  ===>  1, 5 

...

结果，我尝试压缩倒排索引。

0. 对它们进行排序
1. 去掉与前一个值 (RLE) 相比 +1 的任何值
2. 使用 Lemire 的 SIMDCompression github 压缩每个索引列表（我还尝试了他的FastPFor算法）

不幸的是，这种压缩索引的尝试并不好。在实际压缩使用每个整数 20-64 位之后，它只产生了约 75% 的压缩率。请注意，之前我提到我使用的是 32 位数字。压缩使索引列表只有 1 个数字，是其原始大小的 2 倍（我希望它保持不变）。

使用倒排索引的尝试是徒劳的——当它与原始大小相当时，不足以证明额外处理是合理的。

我还有一些其他的想法：

• 确定最常见的数字序列，使用“霍夫曼”类型编码，您可以在其中指定某个值来表示它。

• 压缩算法在处理更多数据时效果更好 - 可能将所有索引连接到 1 个数组中，然后压缩一次？

压缩倒排索引的最佳方法是什么？

有理论上的最小压缩吗？

你知道我可以用什么方法来代替这个吗？

任何输入表示赞赏。

示例数据

• 使用索引“quote --> [indexes]”格式化的股票价格- （不对索引进行处理）

笔记

• 索引的使用将仅用于重建数据集，而不用于任何其他查询。

标签： indexingcompressioninverted-indexbit-packing

Answer 1

整个排序的事情似乎毫无意义。

我取了你的 8000（不是 9000）值系列，取了差异，并将它们写为可变长度整数，产生大约 14,000 个字节。然后我用 gzip 压缩得到大约 6000 字节。你没有说你的 25% 的起点是什么，但如果是四字节二进制整数（32,000 字节），那么这种方法会将其减少到 20% 以下。